Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSCP56915 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSCP56915 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSCP56915 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms