Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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