Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIF1P55008 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIF1P55008 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms