Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEK3P51956 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms