Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC1P48995 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC1P48995 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms