Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RABIFP47224 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RABIFP47224 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RABIFP47224 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms