Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms