Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms