Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms