Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms