Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GLI4P10075 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GLI4P10075 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GLI4P10075 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GLI4P10075 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms