Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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