Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms