Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LTAP01374 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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LTAP01374 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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LTAP01374 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LTAP01374 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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LTAP01374 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LTAP01374 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LTAP01374 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LTAP01374 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LTAP01374 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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