Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4FO95754 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms