Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms