Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP104O60308 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP104O60308 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP104O60308 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms