Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBDO15205 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms