Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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