Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms