Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TCAF1Q9Y4C2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TCAF1Q9Y4C2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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