Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRIM35Q9UPQ4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM35Q9UPQ4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM35Q9UPQ4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM35Q9UPQ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM35Q9UPQ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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