Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms