Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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