Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms