Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms