Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms