Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 IMMT-203ENST00000409258 1408 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.17e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-209ENST00000474969 1431 ntTSL 515.69■□□□□ 0.17e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.187e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.237e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ACBD6-204ENST00000475338 964 ntTSL 512.59□□□□□ -0.396e-13■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.527e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.787e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 59.72□□□□□ -0.857e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 GSPT1-205ENST00000562794 501 ntTSL 34.45□□□□□ -1.77e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 GSPT1-207ENST00000564790 491 ntTSL 33.97□□□□□ -1.777e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 LDLR-206ENST00000557958 1881 ntTSL 220.13■□□□□ 0.818e-10■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 NCKAP1-206ENST00000492058 642 ntTSL 510.92□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 AP2M1-209ENST00000448139 601 ntTSL 517.94■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 AARS-205ENST00000567490 533 ntTSL 29.96□□□□□ -0.823e-17■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)30.35■■■□□ 2.452e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 529.11■■■□□ 2.252e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 35.51□□□□□ -1.532e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PKM-221ENST00000568743 580 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.458e-11■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 55.14□□□□□ -1.598e-14■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SRRT-211ENST00000478693 655 ntTSL 213.81□□□□□ -0.26e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 219.51■□□□□ 0.714e-11■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 POR-217ENST00000460892 603 ntTSL 216.29■□□□□ 0.24e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-214ENST00000589416 773 ntTSL 418.67■□□□□ 0.588e-11■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-207ENST00000587840 655 ntTSL 518.56■□□□□ 0.568e-11■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 DDX5-204ENST00000577787 838 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-10■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.681e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.221e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.251e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 520.41■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SRPRA-202ENST00000527817 687 ntTSL 214.77□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 AKT2-215ENST00000476247 488 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 528.33■■■□□ 2.131e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MADD-219ENST00000524530 566 ntTSL 512.61□□□□□ -0.399e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MADD-220ENST00000524686 580 ntTSL 49.73□□□□□ -0.859e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 527.13■■□□□ 1.936e-13■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 HNRNPD-207ENST00000509107 583 ntTSL 525.46■■□□□ 1.676e-13■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 E2F4-205ENST00000565226 446 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 57.93□□□□□ -1.144e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.111e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.225e-7■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 57.14□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 58.81□□□□□ -17e-8■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 SRSF11-208ENST00000463859 1035 ntTSL 54.65□□□□□ -1.673e-11■■□□□ 11.7
DDX24Q9GZR7 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 518.4■□□□□ 0.546e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 315.25■□□□□ 0.033e-11■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 RRP1-206ENST00000492638 1017 ntTSL 219.73■□□□□ 0.752e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT8-209ENST00000414594 693 ntTSL 423.85■■□□□ 1.411e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT8-214ENST00000481794 694 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT8-203ENST00000371493 562 ntTSL 415.15■□□□□ 0.021e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT8-211ENST00000453480 773 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.538e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 33.58□□□□□ -1.842e-10■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 27.67□□□□□ -1.187e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 57.23□□□□□ -1.257e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 HNRNPL-213ENST00000601664 447 ntTSL 1 (best)18.71■□□□□ 0.591e-13■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 313.88□□□□□ -0.193e-10■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 ABHD16A-213ENST00000492899 583 ntTSL 222.14■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DGCR2-203ENST00000467659 2459 ntTSL 520.23■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 ABHD16A-215ENST00000496579 380 ntTSL 216.03■□□□□ 0.164e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 RRP1-204ENST00000475534 588 ntTSL 326.85■■□□□ 1.892e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 RRP1-205ENST00000483896 805 ntTSL 319.13■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-8■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-8■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.991e-8■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 GOLGA2-209ENST00000490257 1964 ntTSL 221.6■■□□□ 1.053e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 ILF3-206ENST00000587505 791 ntTSL 518.39■□□□□ 0.533e-11■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 513.77□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 ARFGAP2-208ENST00000525635 451 ntTSL 214.97□□□□□ -0.018e-11■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 TIAL1-201ENST00000369086 490 ntTSL 25.03□□□□□ -1.62e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.411e-7■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.323e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.353e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.423e-6■■□□□ 11.6
DDX24Q9GZR7 ATP6V0A1-215ENST00000587824 554 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-8■■□□□ 11.6
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