Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms