Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms