Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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