Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM175Q9BSA9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms