Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms