Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms