Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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