Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46DQ8NEK8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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