Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms