Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms