Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SUMO4Q6EEV6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms