Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms