Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HES3Q5TGS1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HES3Q5TGS1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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