Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms