Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms