Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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