Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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