Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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