Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms