Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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