Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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