Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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